昆虫标本制作完成后应存放在昆虫标本盒里。标本盒要求结构密封、防潮，大小式样可根据需要和具体情况而定。标本盒盒盖采用透明玻璃，能集中对标本进行观察和对比。并采用木头双面镶嵌技术，非一般木头片做卡口，增加盒子的密封性能及美观度。标本盒底有一层软模光板便于插针,存放标本。另外标本存入标本盒前还需要注意这些事项：

　　标本盒消毒存放标本前，标本盒应事先扫干净，晾干、并用杀虫剂消毒，通常用或福尔马林喷杀或熏杀。然后将标本按登记分类顺序放入柜里保存。标本入柜后，还必须经常抽查是否有发霉、虫害、损伤等，如有发现应及时处理。

　　入标本盒前要使标本干透，并在标本盒里放樟脑丸、干燥剂。若标本发霉，可用毛笔轻轻扫去菌丝体，再蘸点石炭酸或福尔马林涂在标本上，也可用红外灯烘干，紫外灯消毒。平时取入标本时要随手关好柜门。

　　此外，在从昆虫标本盒中取放标本时，因标本之间互相磨擦也会使标本某部份脱落、破碎。这就要求在操作时轻拿轻放，需要取一叠标本中的某一份标本时，必须整叠取出，放在桌上再逐份翻阅，切忌从中硬抽。为减少标本之间的磨损，可用牛皮纸或硬纸将标本逐份或分类夹好。